重庆市中医院即重庆市中医研究院，是集中医医疗、科研教学、中药制剂、信息研究为一体的三级甲等中医院，是卫生部审定的高等医学教育临床教学基地、全国中医急症培训中心。医院现有业务用房3万余M2，资产总额2亿余元，医疗设备总值近2千万元。在编职工675人，专业技术人员561人，高级专业人员133人，硕士20人，享受国务院政府津贴5人，市级名中医30人。

医院开设病床416张，设有一级临床科室20个，二级临床科室11个，药剂和医技科室11个。拥有国家级中医重点专科针灸科、妇科；市级中医重点专科脾胃病科、肾病科、肛肠科。急诊科是重庆市中医急症救治中心，肛肠科是重庆市肛肠病防治中心，院内重点特色专科有肿瘤科、肝病科、老年病科、皮肤科等。拥有较健全的科研体系，科研在编人员44人，包括基础部、临床研究部、中医药信息中心、《中国中医急症》编辑部等。

重庆市中医院是具有百年优久历史，因名医荟萃、医疗技术精湛而久享盛誉。历史上汇集了吴棹仙、龚志贤、张锡君、史方奇、陈枢燮等名中医和以曹良仁、黄星垣、郑新等为代表的中西医结合专家，为医院业务建设奠定了坚实基础。医院首创中医急症研究，所研制的参麦注射液成为全国中医急症必备中成药；国家级重点专科针灸科擅长治疗中风、面瘫、痹症、减肥、各种痛症等，开展了小针刀、埋线疗法治疗骨质增生、肥胖症等新技术；国家级重点专科妇科采取中西医结合治疗不孕症、盆腔炎等疑难杂症，疗效确切，给不孕家庭带来福音，开展了阴道B超、腹腔镜手术等新技术；肛肠科首创的“枯切疗法”疗效好，获得国家专利和全国及省市科技成果奖，积极引进激光、微波、红外线治疗仪、电脑痔疮治疗仪、电子结肠镜等现代诊疗设备，丰富了治疗手段，对复杂性难治性痔瘘、直肠脱垂、结肠炎、大肠癌等取得满意疗效，经常参加全市疑难肛肠病的会诊手术，深受患者和同行的好评。著名中西医结合肾病专家郑新坚持以中医为主，结合现代医学治疗急慢性肾炎、肾病综合征等肾系疾病，疗效显著，重症肾衰竭患者在血透基础上使用医院自制中药制剂，提高了疗效，减轻了西药毒副作用，提高了患者生存质量。肿瘤科以传统中医方法和制剂，结合现代手术化疗，减轻了手术和化疗带来的毒副作用，改善了病人生存状态。肝病科在治疗各型肝病方面积累了大量经验，对各型肝炎、肝硬化等疗效明确。骨伤科在传统手法复位、中药外敷、推拿等治疗基础上，引进现代理疗仪器和人工关节置换术等现代手术，开展了熏蒸、腊疗等特色理疗。外科积极引进人才和技术，开展了普通外科、肿瘤等手术。医院脾胃病科、老年科、呼吸内科、内分泌科、四肢血管科、皮肤科等在长期的医疗实践中积累了丰富经验，形成了各自特色，对各种老年病、糖尿病、慢支炎、肺心病、脉管炎、各种皮肤病、中医美容等疗效独道，深受患者好评。